Fundado por iniciativa de D. Sancho II, em 1241, num arrabalde da cidade de Lisboa (Campo da Corredoura), teve as suas obras de construção concluídas em 1259. Foi objecto de sucessivas campanhas de reconstrução e ampliação, as primeiras no reinado de D. Manuel I, face aos prejuízos provocados no edifício pelas diversas cheias que o haviam anteriormente atingido, e sobretudo após o terramoto de 1531, que obrigou a uma reconstrução quase total do convento, que se prolongaria até ao início do séc. XVIII. O terramoto de 1755, com o violento incêndio que se lhe sucedeu, afectou duramente a igreja e as dependências conventuais, em grande parte reduzidas a escombros. A intensa campanha de reconstrução que se lhe seguiu prolongar-se-ia até inícios do século XIX, pouco antes da extinção da comunidade em virtude do decreto governamental de 1834. O seu aspecto actual faz memória de um outro incêndio, ocorrido já em 1959, cujas marcas se mantiveram após o restauro recente da igreja. No convento lisboeta funcionou também um estudo geral de Filosofia e Teologia. Dedicado a S. Tomás de Aquino, esse Colégio, fundado em 1517, acabaria por transitar para o Convento da Batalha em 1538 e posteriormente para Coimbra. Junto ao convento existia ainda a famosa ermida de Nossa Senhora da Escada, destino de peregrinações, onde se fundaram importantes confrarias ligadas ao culto do nome de Jesus e a diversas comunidades de mercadores estrangeiros sedeadas em Lisboa.

Convento fundado em 1239, sobre a ermida de São Bento do Mato, doada aos franciscanos pelos freires de Avis. A igreja é edificada por ordem de D. Afonso III e sua mulher, D. Beatriz. Por bula de Alexandre IV de 13 de Dezembro de 1258, é concedido poder ao arcebispo de Compostela, constituído como conservador do convento, para fazer face aos desmandos dos freires de Avis que ameaçavam o convento franciscano.O convento recebe inúmeros privilégios, entre os quais se destacamos que pertenciam à capela de Estefânia Mendes e os que são outorgados pelo rei D. João III. Começa este convento nos rigores da observância, passa a claustral em 1274, regressando depois à observância em 1572. Profundamente remodelado entre os séculos XVI e XVIII, acabaria por ser extinto em virtude do decreto de 1834.

Convento fundado em 1681 por iniciativa da princesa D. Maria, filha de D. João IV. Por determinação do Capítulo Geral da Ordem de 1787, funcionou neste convento um Colégio de Filosofia. Foi extinto em 1834.

Província formada a partir dos conventos de recolecção ou de retiro da Custódia de S. Tomé, formalmente erecta em 1622, pela Constituição Apostólica Sacri Apostulatus de 11 de Janeiro, após dois anos com o estatuto de custódia. Foi suprimida em 1835, em cumprimento do decreto de extinção das ordens de 28 de Maio de 1834.

Após a chegada dos primeiros franciscanos à Índia, logo em 1500, foi criado, em 1518, um Comissariado, dependente da Província Observante de Portugal, transformado em Custódia em 1542, sob a invocação do apóstolo S. Tomé e ainda na dependência da Província portuguesa. Apesar de tentativas anteriores e de documentos pontifícios determinando a sua elevação a Província, a custódia só seria erecta como tal em 1619. Foi suprimida em 1835, em cumprimento do decreto de extinção das ordens de 28 de Maio de 1834.

Desconhecida. Apenas se supõe que funcionou no edifício da Misericórdia na Rua Padre Luís António da Cruz e que há registo de funcionamento entre 1943 e 1973.

Fundado em 1751, junto a uma capela pertencente a um certo Manuel Colaço. O respectivo superior, entretanto nomeado como guardião, integraria, já em 1760, o conjunto dos frades com direito a participar no Capítulo Provincial. Foi suprimido em 1835, em cumprimento do decreto de extinção das ordens de 28 de Maio de 1834.

Erecta na Igreja Matriz de Viana do Alentejo

Instituída pelo bispo D. Diogo Correia. Os estatutos datam de 1611. Em 1730 o reitor era o bispo, mas esse facto verificava-se por acumulação de funções. A documentação disponível atinge o ano de 1767.

Mosteiro fundado em 1562 por D. Ângela de Moura na própria casa onde nascera. Por se situar no interior da cerca do castelo e junto à igreja matriz, esta dedicada a Santa Maria e edificada sobre a antiga mesquita da vila, o novo mosteiro acabaria por integrar este templo, convertendo-o no espaço de culto da comunidade. Realizadas as necessárias obras, nele entrariam as monjas em Outubro de 1566, oriundas, na sua maioria e tal como a fundadora, do mosteiro do Paraíso de Évora. Duramente afectado pelo terramoto de 1755, o cenóbio sofreria importantes obras de reconstrução, sendo extinto em 1875, com a morte da última religiosa.